上海最好吃的日料店有多個選擇，根據不同的評價和口味偏好，以下幾家餐廳被認為是極佳的選擇：
KUROGI。這家店位於上海市虹口區，是一家高端的日料餐廳，以其昂貴的價格和優質的服務著稱，提供東京最難定位的紅店之一的料理。
榮新館。位於上海市長寧區，是一家以日本料理自助餐聞名的餐廳，以其上乘的選材和水平完全不次於精品日料店的服務而受到推崇。
萬島日本料理鐵板燒。在上海市有多家分店，以鐵板燒為主打，提供新鮮的大個海膽和牡丹蝦，以及豐富的壽司和刺身選擇。
酒吞。位於上海市多家分店，以刺身新鮮程度高和鵝肝壽司等必點菜品著稱。
Maki House壽司。在上海市有多家分店，以豐富的壽司種類和性價比高而受到歡迎。
此外，覺米ChewMii、八樽燒肉居酒屋、DEMO CAFE、大江戶日本料理和真田食堂等也是極佳的選擇，各有特色，提供從傳統到創新的各種日式料理。