保密檔案是指記載涉及軍事秘密事項與信息的檔案，包括機關之間相互往來具有規範格式的公文、機關內處理事務的內部檔案和各種信息記錄。按記錄信息的載體，可分為紙質檔案和其他載體檔案，如感光膠片檔案、磁介質檔案、半導體介質檔案和光碟檔案等。軍隊絕密檔案所含信息內容涉及國家和軍隊最核心、最重要的軍事秘密，一旦洩露會使國防和軍隊的安全與利益遭受特別嚴重的損害。軍隊機密檔案所含信息內容涉及國家和軍隊重要的軍事秘密，洩露會使國防和軍隊的安全與利益遭受嚴重的損害。軍隊秘密檔案所含信息內容涉及國家和軍隊一般的軍事秘密，洩露會使國防和軍隊的安全與利益遭受一定的損害。軍隊檔案秘密等級的確定，由承辦人按照軍事秘密及密級劃分規定提出建議，經有規定許可權的機關及指揮員批準。嚴格管理涉密檔案，維護涉密信息及其載體的安全，是軍隊機關日常檔案管理和保密工作的重要任務。