功能性肥料，也稱為功效性肥料或多功能肥料，是一種專門針對作物營養需求設計的肥料，具有多種特殊用途和效果。
功能性肥料在傳統肥料的基礎上添加了生物活性物質或功能性添加劑，以改良土壤、增強農作物的抗病力、促進植株生長，並提高肥料利用率。這類肥料的目的在於提高單位肥料對農作物增產的效率，並通過改善水分利用率、土壤結構、提高作物抗倒伏能力等手段，增加作物的品質。功能性肥料能夠提供營養元素、調節土壤肥力，同時具有提高作物抗逆性、改善品質和增加經濟效益等多重效果。它們可以根據作用機制分為植物生長調節劑類、生物菌劑類、複合增效劑類等。這些肥料還具有改良土壤、生根養根、著色增甜、抗逆防凍等多種特定功能，以滿足不同植物在不同生長時期的需求。