生物色素是生物細胞中的一類化學物質，它們因爲具有特殊的化學結構，能夠對光線造成反射、干涉、散射或吸收等效果，從而使生物組織呈現出不同的顏色。生物色素的種類很多，動物體內常見的有黑色素、嘌呤色素、喋呤色素、血紅素等；植物體內主要有葉綠素、類胡蘿蔔素、醌類色素和黃酮類色素等。生物色素在生物化學上可以分爲生物色與構形色，其中生物色包括真色素，如類胡蘿蔔素和蝶酸，這些色素能吸收部分波長範圍的可見光。例如，黑色素是一種生物色素，是酪氨酸或3,4-二羥苯丙氨經過一連串化學反應所形成，動物、植物與原生生物都有這種相同色素。