核酸分子中含量較少的鹼基
稀有鹼基，也稱為修飾鹼基，是核酸分子中含量較少的鹼基。
這些鹼基是天然存在的，並非人工合成，通常是在核酸轉錄後通過甲基化、乙醯化、氫化、氟化或硫化等化學修飾過程形成。稀有鹼基的結構多種多樣，大多數是主要鹼基的甲基衍生物，例如5-甲基胞苷和5,6-雙氫脲苷等。
此外，還有一種特殊的核苷，如假尿嘧啶核苷，由於其獨特的鹼基與核糖連線方式而成為稀有鹼基的例子。在tRNA中通常含有較多的稀有鹼基，某些tRNA中的稀有鹼基比例可達10%，相比之下，rRNA和mRNA中稀有鹼基的含量則相對較少。