程式檔案的概念取決於其套用的上下文，在質量管理領域中，程式檔案是質量管理體系的一部分，位於質量手冊之下，具體作用如下：
規定某項工作的一般過程。
使質量活動受控，並對影響質量的各項活動做出規定。
闡明與質量活動有關人員的責任，作為執行、驗證和評審質量活動的依據。
規定各項活動的方法和評定的準則，確保各項活動處於受控狀態。程式檔案的規定在實際活動中執行，執行情況應留下證據，以便依據程式審核實際運作是否符合要求。
在計算機領域中，程式檔案是電腦程式的一種表現形式，包含實現特定功能的代碼、數據、資源以及相關的元數據。這些元素共同構成了程式檔案的完整體系，確保軟體能夠按照預定的邏輯運行。程式檔案存儲的是程式，包括源程式和可執行程式，其中代碼是最為核心的部分，告訴計算機如何執行特定的操作。此外，程式檔案還可能包含數據、資源檔案和元數據，分別用於存儲程式運行過程中需要使用的臨時數據、多媒體素材或配置檔案，以及描述程式檔案的屬性、版本、依賴關係等信息。