偏航阻尼器的工作原理主要基於自動控制、反饋控制和調節控制等原理。其核心作用是保持飛機因荷蘭滾和氣流顛簸引起的不穩定，確保飛機在其垂直軸線的穩定性。具體來說，當飛機受到側向風的作用或其他擾動時，偏航阻尼器會通過感測器檢測到偏航角度的變化，並將數據傳輸給計算機。
計算機分析這些數據，並根據飛機的狀態和條件制定最佳的偏航控制方案。然後，計算機會通過電氣或液壓控制系統，將相應指令傳輸到偏航阻尼器，對飛機進行實時的反饋和控制。例如，當飛機出現偏航時，偏航阻尼器會產生反作用力矩，阻止飛機過度偏航。這個過程類似於汽車上的方向盤阻尼器，保證車輛行駛方向的穩定性。
此外，偏航阻尼器還通過消耗掉因飛機在飛行中所產生的側向運動而引起的偏航轉矩，使得飛機具有更好的穩定性。在某些情況下，偏航阻尼器會根據陀螺儀或加速計測得的偏航率調整方向舵輸入，有效地阻尼顛簸和荷蘭滾運動。總的來說，偏航阻尼器通過自動調整方向舵的偏轉角，抑制飛機的偏航運動，保持飛行的平穩和安全。