《傾世皇妃》的結局是多層次且充滿情感波折的。以下是該劇的主要情節：
1.馥雅（由林心如飾演）最終認清了弟弟度雲（由嚴屹寬飾演）的真實面目，發現他爲了權力不惜傷害他人。在度雲登基的當天，馥雅利用皇冠上的簪子刺死了度雲。
2.馥雅離開深宮，前往相思湖畔，與她深愛的祈佑（由嚴屹寬飾演）重逢。祈佑一直在相思湖畔等待她，直到度雲死去。
3.太后（由潘虹飾演）希望連曦（由高梓淇飾演）登基，但連曦與太后之間存在矛盾。連曦被毒害，太后犧牲自己救了他，最終連曦登基。
4.孟祈佑（由嚴屹寬飾演）在保護馥雅的過程中被箭射穿心臟，落入水中，最終因傷重而死去。
綜上所述，該劇的結局既有對邪惡的懲罰，也有對愛情的堅守，以及對於權力的深刻反思。