南京的日本料理非常多樣，從高端的懷石料理和會席料理，到平價的拉麵店和壽司店，應有盡有。以下是一些推薦的日本料理餐廳：
汀蟬：位於南京新街口，以其多樣化的日本料理和高端的環境而聞名，人均消費約為1341元人民幣，人氣指數高達18366。
鮨一：2016年入駐南京，總店位於上海，提供Omakase（廚師發辦）的套餐形式和板前料理，人均消費約為1382元人民幣，人氣指數為18272。
鮨極：與鮨一有著極高的相似性，同樣提供Omakase套餐，人均消費約為1640元人民幣，人氣指數為14589。
水之惠：屬於南京的老牌日料店，前身名為拾得料理店，提供多種日式料理，人均消費約為245元人民幣，人氣指數為19615。
坂亭府：源自上海赤坂亭餐飲，提供鐵板燒等日式料理，人均消費約為822元人民幣，人氣指數為13662。
魚四季創作日本料理：提供多種日式料理，人均消費約為351元人民幣，人氣指數為17753。
本湖月日本料理：位於玄武湖畔，提供多種日式料理，人均消費約為300元人民幣，人氣指數為18151。
煙花·爐端燒：提供日式燒烤等日式料理，人均消費約為380元人民幣，人氣指數為17732。
古南都那古野日本料理：提供多種日式料理，人均消費約為261元人民幣，環境優雅，服務熱情。
以上餐廳均提供高品質的日本料理，可以根據個人口味和預算選擇適合的餐廳。