南派三叔的作品集主要包括以下幾個系列：
《盜墓筆記》系列。這是南派三叔的代表作，講述了吳邪、張麒麟、胖子等人進入古墓探險的故事。《盜墓筆記》系列包括《七星魯王宮》《怒海潛沙》《秦嶺神樹》等。
《大漠蒼狼》系列。該系列包括《絕地勘探》和《絕密飛行》。
《怒江之戰》系列。包括《怒江之戰》和《怒江之戰·大結局》。
《藏海花》系列。該系列從《盜墓筆記》結束後的第五個年頭開始，主要介紹張麒麟的身世之謎，並解答《盜墓筆記》中留下的疑問。
《沙海》系列。講述了吳邪被捲入一個神秘計劃的故事，包括《沙海1：荒沙詭影》《沙海2：古鎮迷局》《沙海3：沙蟒蛇巢》。
《老九門》系列。包括《老九門—湘西往事》等。
除此之外，南派三叔的作品還包括《花夜前行無聲落幕》《雨村筆記》《燈海尋屍》《萬山極夜》等。這些作品進一步擴展了南派三叔的文學世界，深受讀者喜愛。