打磨原子灰的方法包括以下步驟：
清理表面。在打磨前，需要先清理表面，除去油污、鏽蝕、舊漆和水分，確保表面乾燥和平整。
混合原子灰。將主灰和固化劑按照100:1.5到1.5:3的比例混合，確保色澤一致。
塗刮原子灰。用刮刀塗刮調好的原子灰在打磨後的雙組份底漆或已處理的板材上，薄刮至所需厚度，有氣泡要刮平。
打磨原子灰。打磨原子灰層可採用手工或機械乾磨。機械打磨適用於修補面積較大以及平整的底材，可降低勞動強度，提高工作效率。手工打磨適用於一些形狀複雜的底材，如轉角、折口、外形線、弧形，凹形部位等。
塗抹打磨指示層。原子灰本身沒有亮度，表面刮塗不平整，砂眼、砂紙痕等瑕疵都不容易看出，所以可通過在原子灰上施塗打磨指示層來幫助打磨者判斷表面狀況。打磨指示層為黑色，打磨前只需要薄薄塗抹一層，在打磨時由於較低部位及存在砂眼、砂紙痕的部位會留有碳粉而呈現為黑色，這樣就可以方便判斷哪裡需要繼續刮塗原子灰。
打磨方法。首先使用粗砂紙進行打磨，然後逐漸過渡到更細的砂紙，例如從P80#、P120#到P180#。在打磨過程中，應檢查原子灰表面是否已填平，如果有凹陷，繼續刮塗原子灰並再次重複以上操作進行打磨。
通過這些步驟，可以有效地打磨原子灰，確保表面平整和光滑。