合香珠的配方有多種選擇，以下是幾種示例：
艾草合香。使用艾草、紫蘇、側柏、蒼朮、桂皮、五指毛桃、廣藿香、川芎、白芷、薄荷等中藥材，按一定比例混合。
桂香合香。包含桂皮、蒼朮、白芷、川芎、五指毛桃、廣藿香、薄荷、沒藥、龍腦、檀香等中藥材，按特定比例配製。
檀香合香。由檀香、如意、黃芩、當歸、白芷、廣藿香、丁香、蘇木、防風等中藥材組成，按比例搭配。
簡易配方。沉香60%、甘松3%、龍腦2%、蜂蜜5%、粘粉30%，適用於所有人。
特殊配方。老山檀8克、玫瑰粉8克、洛神花5克、薄荷8克、陳皮4克、佛手4克、香附2克、鬱金香2克、安息香2克、楠木粘粉13克。
製作合香珠時，需要將各種藥材混合打粉，加入適量的植物粘粉和山泉水攪拌和泥，然後手工搓成球形，放入模具中壓實，最後陰乾以防開裂。每個配方都有其獨特香氣和用途，可根據個人喜好和需要選擇合適的配方。