土壤消毒的方法有多種，主要包括物理消毒和化學消毒。物理消毒方法有：
日光暴曬。將土壤平鋪在全天有光照的地方，如水泥板或樓頂，暴曬3~5天。
蒸汽消毒。使用專業的蒸汽消毒設備，將高溫蒸汽注入土壤中。
開水消毒。將土壤裝入能夠儲水的容器中，加入開水，攪拌均勻。
微波消毒。對於少量的土壤，可以利用微波爐進行消毒。
高溫翻炒。使用鐵鍋或大鍋，將土壤加熱至140度後翻炒50分鐘左右。
化學消毒方法有：
藥劑消毒。使用化學農藥、甲醛、過氧化物等對土壤進行噴淋或澆灌。
月光消毒。將土壤薄薄平攤在日光下暴曬3到15天。
此外，還有生物消毒法，如利用有益微生物和生物防治劑來降低病原體數量，以及合理的輪作和間種等措施來改善土壤健康。選擇具體的消毒方法取決於土壤的用途、可用資源以及環境條件。在使用化學藥劑時，應注意安全操作，避免對環境和人體造成傷害。