基金轉換的淨值計算規則與基金申購基本相同，遵循“未知價”原則，即申購和贖回以申請當日收市後的基金份額資產淨值爲基礎計算其買入的基金份額或賣出所獲得的金額。具體來說，如果基金轉換髮生在T日的15:00前，那麼就按照當天的收盤價進行淨值計算；如果基金轉換髮生在T日的15:00以後，則按照T+1日收盤的淨值計算。
此外，如果投資者在當天下午的3點以前將基金A轉換爲基金B的話，那麼當天的收益就是算基金A的，而下個交易日是算基金B的；如果投資者在當天下午的3點以後纔將基金A轉換爲基金B的話，那麼當天的收益以及下個交易日的收益都是算基金A的，下下個交易日的收益纔算基金B的。
需要注意的是，QDII、LOF類基金、還有處於封閉期的基金，是不能進行基金轉換的。