宗教的局限性可以從多個角度來理解。首先，多神教信仰體系由於其範圍廣雜和繁複的儀式，往往無法成為統一的精神力量。例如，羅馬傳統宗教的衰微部分原因在於其複雜的崇拜儀式和缺乏統一的神學理論及團體性傳教組織。
其次，宗教之間的衝突和戰爭也是宗教局限性的體現。歷史上，人類的戰爭很大程度上是不同宗教或宗教信仰之間的衝突，這種衝突導致了血流成河的悲劇。在當代，這種衝突仍然存在，如亨廷頓的文明衝突理論所指出的，宗教差異可能導致社會緊張和衝突。
此外，一些宗教在現代社會中的適應性問題也是其局限性之一。例如，儒教在現代社會中面臨的挑戰，包括其彌散型特徵和與法律體系的融合問題，這些都為其現代轉型帶來了困境。
最後，不同宗教對於至高神性的設定和天人溝通的形式上的差異，也體現了宗教的局限性。這些差異可能導致宗教內部的分裂，或者在不同宗教信仰者之間的誤解和衝突。