小三通訂票的方式主要有以下幾種：
通過官方網站訂票：進入購票頁面後，選擇出發日期和出發航班，點擊餘票後進行訂票。登錄賬戶，如果是新用戶，可以使用大陸手機號或郵箱註冊。在訂單確認頁面，添加旅客信息並保存，填寫驗證碼和同意訂票須知後提交訂單。最後在訂單支付頁面選擇支付方式並確認支付。
通過微信公衆號訂票：搭乘“兩馬”航線的旅客可以關注“福州港馬尾琅岐客運站”微信公衆號，選擇“我要預定”→“兩馬船票”→“船票”→“訂購船票”，確認出行日期及旅客信息後付款完成訂票。搭乘“黃馬”航線的旅客可以關注“福州港客運站”微信公衆號，選擇“航線售票”→“黃岐航線售票”→“船票”→選擇出行日期後訂票，同樣確認信息後付款。
請注意，通過微信公衆號訂票的旅客需要在航班開航前1個小時抵達客運站售票櫃檯取票。希望這些信息對您有所幫助。