在《寶可夢》系列動畫中，主角小智的父親身份一直是一個未解之謎。儘管存在一些網友的猜測和討論，例如有人認為大木博士（即大木）是小智的親生父親，或者官方編劇就是小智的父親，但這些都缺乏官方的明確證實。根據最新的動畫特別節目，小智的父親似乎是大木博士，這一信息為多年來的猜測提供了一定的證實。然而，這仍然需要進一步的官方資料來確認。至於小智的母親，有說法提到她是大木博士後來的妻子，後來才生下小智，因此小智可能是小茂的叔叔。
綜上所述，小智的父親最有可能是大木博士，但這一結論需要更多的官方信息來支持。在目前的情況下，我們不能完全確定小智的父親是誰，只能根據動畫特別節目提供的信息進行推測。