巴拉圭河的支流包括:
貝爾梅霍河(Río Bermejo):源出玻利維亞塔里哈(Tarija)附近,流經阿根廷,最後在巴拉圭的皮拉爾(Pilar)對面匯入巴拉圭河,全長約1,046公里。
皮科馬約河:作為巴拉圭河的一個重要支流,它與貝爾梅霍河一同構成了巴拉圭河的主要水源。
特維夸里河、庫亞巴河、塔夸里河、米蘭達河、阿帕河:這些河流也是巴拉圭河的支流,它們共同為巴拉圭河提供了豐富的水資源。
巴拉圭河是南美洲第五大河流,也是巴拉那河的主要支流。它的流量季節變化較大,其中科倫巴以上的河段汛期一般為每年1~3月份,而科倫巴以下的河段汛期一般為每年6~8月份。