《帶著珍珠耳環的少女》是一個關於人與時代的悲劇故事。該故事背景是1960年代初的東南亞某國家，那時正值青春年少的真慧美被國家的歷史浪潮裹挾至畫家個人構思的世界，去經營一段虛擬的生死奇遇，最後因真相終於公之於眾，卻感到了痛苦的憐憫。故事內容可以分解為三部分：
第一部分：真慧美在國家危難之時被召進一個軍人總監的個人藝術世界裡，這是一個被極權和歷史煙幕遮蔽的時代。真慧美與軍人總監在各自立場的立場和防範之間產生了情愫，他們以生命和青春為代價去體驗一個悲劇性的人生故事。
第二部分：真慧美隨軍人總監開始了他的軍旅生涯，在此過程中真慧美給了他作為戰利品收下的戰利品珍珠耳環，而在經歷國家的數次歷史逆襲與暴政年代終結之際，她逃過一劫回到了國民生活，過著和平平凡的日子。這些細微的情感和悲劇性的人生故事被真慧美以繪畫的形式記錄下來，繪畫中的少女和軍人總監的歷史悲劇故事成為了國民歷史的一部分。
第三部分：真慧美的親人和朋友在真相公之於眾後感到痛苦的憐憫，他們為真慧美和軍人總監的人生悲劇感到無力無助。而真慧美在國民時代過去的數十年後，仍然用她的繪畫記錄著當時的人和事，用她的人生悲劇故事去喚醒當今時代人的思考。
故事最後真慧美終於回到了她曾經被國家的歷史逆襲所奪走的家庭生活，但是她的一生都充滿了悲劇和夢幻色彩的青春往事。這是一個充滿愛與夢想的時代悲劇故事，它告訴我們，即使在歷史的煙霧中，人們依然可以找到愛與希望的種子。