《康熙字典》的查字方法主要有兩種，部首檢字法和筆畫檢字法。
部首檢字法。這種方法適用於查找常用字，例如，要查「康」字，首先在部首索引中找到「廣」部，然後在「寅集下」的部分查找，因為「廣」部在「寅集下」。除去部首外，「康」字的筆畫數為8畫，因此在「廣」部的8畫裡可以找到「康」字。
筆畫檢字法。這種方法適用於查找難字或不知道部首的字。例如，要查「民」字，首先數出該字的筆畫數為5畫，然後在5畫的部分查找「民」字。由於「民」字下標註有「氏」部，接下來在「氏」部的索引中查找，最後在「氏」部的相關頁碼中找到「民」字。
為了方便記憶，《康熙字典》還提供了一首查字訣：「一二子中尋，三畫問醜寅，四在卯辰巳，五午六未申，七酉八九戌，其餘亥部存」。這首查字訣可以幫助用戶快速定位到某個字的查找位置。