製作EPUB檔案的方法有多種，以下是一些常用的方法：
使用Word文檔轉換。首先準備內容，可以通過手動撰寫、將圖片轉換為文字（使用OCR外掛程式）、或將PDF檔案轉換為Word文檔。然後在Word文檔中完成內容編輯，接著在Word中導出為EPUB格式。在Word中，選擇「檔案」選項卡，點擊「下載為」，在格式中選擇EPUB。
使用XHTML編輯器。首先創建多個XHTML文檔，每個檔案代表電子書中的一章或其它部分（例如封面、目錄、參考頁面等）。然後使用EPUB編輯器（如Calibre）創建一個新的EPUB格式電子書。在編輯器中輸入電子書的元數據，並導入之前創建的XHTML文檔。完成後保存，即可得到EPUB格式的電子書。
使用Adobe InDesign。首先準備電子書的內容，包括書籍的基本信息（如書名、作者、出版社、ISBN等）和原始文檔（可以是TXT、Word或其他可複製的文檔格式）。然後處理並保存圖片為JPG或PNG格式。使用Adobe InDesign創建新的文檔，並導入準備好的內容。在InDesign中完成版面設計後，將文檔導出為EPUB格式。
這些方法各有優劣，選擇哪種方法取決於你的具體需求和可用資源。例如，如果你熟悉網頁開發，可能會傾向於使用XHTML編輯器；如果你需要更高級的排版功能，可能會選擇使用Adobe InDesign。