愛玉由來故事有以下幾種說法：
1. 炎皇子孫說 。愛玉子是炎皇之子，為保護百姓免受戰亂之苦，化身為白兔，不幸被獵人殺害，其眼淚滑入土地之後長出白色果子，也就是現在的愛玉果；
2. 藥王恩賜說 。藥王孫思邈隱居於尤溪縣民間，發現愛玉子不但能夠清熱解毒、潤肺止咳，還能治療胃病，便將愛玉子列為“長生不老藥”的原料。
3. 自生自足說 。因為愛玉子生長在綠蔭樹下，借著樹蔭的遮蔽，能夠自動吸收土裡的養分和露水，自然生長，所以不需要人工特別照顧；
4. 與佛家有關 。有說在五台山上有一顆神奇的樹木，從樹枝到樹葉都是乳白色的葉子，更加奇特的是無論炎夏多么乾旱它都不會枯萎，更有傳言每當進入九九重陽節的時候它會主動往樹幹上滴乳白色的汁液。
以上就是關於愛玉由來的一些說法，可能因為地域、文化背景等的不同說法也不同。