慎思明辨的故事有很多，其中比較著名的一個是“孔子的慎思明辨”。
有一天，孔子與他的學生們正在討論學問，話題涉及到了人性本善還是本惡。其中一位學生說人本來就善，孔子搖了搖頭說：“我認為人本來是‘相近’的，如同鳥的羽毛一樣。有些善，有些惡。”另一個學生馬上反駁：“我認為人之初是‘性本善’的，就像剛剛說的那樣。” 孔子便讓在場的所有學生不要說話，先讓他們去外面看看天、再看看樹。學生看了看，回來後表示不理解。孔子便對他們說：“你們看天時，看到的是什麼？是日月星辰，風雨雷電；看樹時看到的是枝繁葉茂。這就是樹木生長時的爭鬥與生長，這就是它們自然而為的。”孔子接著說：“那么，人生來就具備仁、義、禮、智、信等天賦的東西，只是表現形式和程度各有不同罷了。”
這個故事說明了孔子在思考問題時非常謹慎，會從多個角度去分析和判斷，這種思考方式就是“慎思”。同時，孔子也強調要明白事理，不要被表面現象所迷惑，要透過現象看本質，這種判斷方式就是“明辨”。
除了這個故事之外，還有很多關於慎思明辨的故事，這些故事都強調了思考和判斷的重要性。在現代社會中，我們也應該保持慎思明辨的習慣，在面對各種問題時能夠理性地分析和判斷，做出正確的決策。