成吉思汗的後代分布廣泛，主要可以分為以下幾部分：
蒙古本土及其周邊地區：成吉思汗的弟弟們封國在中國東北部，也留在本土。中國蒙古族主體是明清時期漠南蒙古人，包含成吉思汗的嫡系傳人，人口約為650萬，主要分布內蒙古、東北，在新疆、河北、青海都有分布，其餘散布於河南、四川、貴州、北京和雲南等地。
中亞和西亞地區：成吉思汗長子朮赤和他的金帳汗國後裔演變形成了韃靼人、烏孜別克人和哈薩克人。三子的窩闊台汗國後來併入了二子的察合台汗國，他們的很多後裔又融入了烏孜別克人和哈薩克人中；還有一部分回遷到蒙古高原，繼續遊牧。
歐洲和西亞地區：蒙古人在印度建立了莫臥兒王朝，印度人里也有一部分蒙古後裔。歐洲和西亞,中亞的蒙古後裔經800年混血,很多已經接近白種人；而蒙古高原地區的後裔還是典型的黃種人。
其他地區：成吉思汗的後代在歷史上多次西征，其家族染色體撒播到世界各處，後人主要分布在俄羅斯、匈牙利、挪威、芬蘭、阿富汗等地。
此外，元朝滅亡(公元1368年)之後，成吉思汗的後代逃離大都，前往四川，並改姓為余。他們在逃亡的過程中分散至重慶、瀘州、富順、納溪、青神、榮縣、樂山等地，並最終在余家灣定居，延續了600多年的時間。