《戰國無雙3》的故事是圍繞著日本戰國時期各大名將及其家族展開的，講述了從1555年到1603年這段日本戰國時期的故事。在這個故事中，玩家將體驗到日本戰國時期各大名將的故事，包括秀吉、上杉謙信、前田利家、伊達政宗、直江兼續等角色，每個角色都有各自獨立的劇本，例如秀吉的統一日本的大業、謙信對抗織田信長的北陸征伐等等。
此外，遊戲中還有無雙武將們為了守護某位大名而進行戰鬥的“守護”故事，以及武將們年輕時的“戰國無二三”系列故事。玩家在遊戲中可以體驗到各種戰國時期的著名戰役，也可以了解到各個武將的性格和成長曆程。
總之，《戰國無雙3》是一個融合了動作和冒險要素的策略遊戲，玩家可以與眾多歷史名將一起戰鬥，守護和平，同時也可以體驗到歷史人物的真實性格和成長曆程。