打水漂的原理主要涉及流體力學和物理學知識，具體可參考如下：
物體（如石頭）掠過水麵時，會帶動它下面的水在非常短的時間內快速流動。根據流體力學原理，流速越大的地方壓強越小，因此快速流動的水區域壓強較低。而下面的水靜止不動，壓強較大，這會在物體上產生一個向上的壓力。
當這個向上的壓力大於物體的重力時，物體就會彈起。如果物體在離開手後能夠保持旋轉（這需要一定的技巧），它會更加有效地帶動水流動，從而增加跳躍的次數。
石頭入水的角度也很關鍵，適當的角度可以使水漂效果更佳。
此外，打水漂的物理原理與太空飛行器重返地球時進入大氣的過程相似，這有助於物理學家模擬和研究太空飛行器的回收過程。