拜耳驅蟲藥的使用方法因寵物種類和年齡而異，具體如下：
對於狗狗，拜耳驅蟲藥通常是根據體重來決定的。內服，每十千克體重一片。可以直接吞服或包於肉或食物中給藥，無需禁食。例如，對於幼犬及小型犬，體重2公斤以下使用1/4粒，體重2~5公斤使用1/2粒，體重5~10公斤使用1粒。中型犬：體重10~20公斤使用2粒，體重20~30公斤使用3粒。大型犬：體重30~40公斤使用4粒。另外，成年狗例行驅蟲，每3個月1次。
對於貓咪，拜耳驅蟲藥用於治療貓咪蛔蟲和絛蟲。用量為2公斤體重1/2粒藥片，4公斤體重1粒藥片，6公斤體重1又1/2粒藥片。幼貓在第6、第8、第12周各服一次，以後每3個月服用一次。成貓（6個月以上）：每3個月服用一次。懷孕母貓：生產前10天，和哺乳期結束後第2和第4周服用。
需要注意的是，拜耳驅蟲藥不應該與鹼性藥物同時使用，且在使用後三天內禁止給狗狗服用鹼性藥物。如果狗狗或貓咪在首次使用後出現腸道反應，如嘔吐或拉肚子，應考慮更換其他類型的驅蟲藥。在服用拜耳驅蟲藥後，寵物可能會出現一些副作用，如腸胃不適或嘔吐，這是正常現象。如果寵物出現嚴重反應，應立即諮詢獸醫。