排水器的工作原理主要取決於其類型，常見的類型包括自動排水器和物理排水器。
自動排水器的工作原理如下：
有一個空氣瓶，類似於氣球。在沒有水的情況下，氣壓會使空氣瓶堵住出水口。
當水累積到一定程度，浮力會變得大於空氣壓力，使空氣瓶上浮並打開排水口。此時，水在氣壓作用下排出。
水排出後，浮力減小，空氣瓶下降並再次堵住排水口。
物理排水器的工作原理如下：
依賴於排水器內部的浮標。當液位上升，浮標隨之上升，帶動閥門自動打開，從而開始排水。
此外，還有電子排水器，其工作原理如下：
電磁閥控制閥門的開合，可以通過設定來調節自動排水開啟的時間和周期。
這些排水器廣泛套用於自動排除系統中的冷凝水，如管道低處、油水分離器、氣罐及各種過濾器底部等處，可安裝在不易進行人工排水的地方，如高處、狹窄處，以防止因忘記排水而導致的系統污染。