製作酵素的方法有多種，以下是一種常見的製作步驟：
準備水果，如蘋果、火龍果、檸檬等，清洗乾淨後，去皮切塊。
將水果放入乾淨的玻璃瓶或塑膠瓶中，加入適量的糖（如紅糖或白砂糖）和水。具體的比例有多種建議，例如糖:水果:水為1:3:10，或者水果與糖的比例為1:1。
確保瓶內無油無水，然後密封瓶子。
將瓶子放置在陰涼、通風、避光的地方進行發酵。每天至少放氣一次，以釋放產生的氣體，並可輕輕搖晃或攪拌瓶子以促進均勻發酵。
發酵時間根據不同的方法和原料而異，一般為1到3個月。發酵完成後，酵素會呈現出特有的酸甜味。
將固體殘渣用濾網撈出，沉澱後，用乾淨的瓶子裝載已發酵的酵素液體，可放在冰櫃中保存。
每種水果酵素的功效略有不同，例如檸檬酵素有助於消化和排毒，而蘋果酵素則有助於清潔腸道。可以根據個人需求和喜好選擇不同的水果進行製作。