製作臭玉米的過程涉及以下步驟：
選取材料。需要新鮮採摘或曬乾且沒有蟲蛀或霉變的玉米，以及釀酒產生的副產品酒糟和新鮮且顆粒飽滿的稻穀。此外，還需要阿魏、公丁香和大黃這三種中藥。
初步加工。將玉米和稻穀加水後放入高壓鍋燉至開裂。
混合材料。趁熱將燉好的玉米和稻穀連同所帶的水一起倒入事先準備的容器中。迅速加入酒糟和藥物，搖勻後密封待用。
密封儲存。密封容器後嚴禁開蓋查看，一周後即可使用。儲存時間越長，效果越好。
以製作10公斤臭玉米為例，阿魏的用量約為30克，公丁香10克，大黃50克。在製作過程中，偶爾發現容器內有蟲蠕動屬於正常現象。