李姓的淵源主要有兩大支：
贏姓：李姓的遠祖可以追溯到4000多年前的「五帝」時代高陽氏顓頊。顓頊氏族屬於東夷族，最早活動於今河南東部，後來北遷到帝丘，即今河南濮陽西南。商朝末年，大臣理征因正直敢言得罪紂王，被害。其妻契和氏攜幼子理利貞出逃，隱於今河南西部嵩縣的伊水旁。因靠樹上的果子(木子)充飢才得以存活，遂改理氏為李氏。
姬姓：商朝時期，巴人居武落鍾離山，在今湖北長陽西北一帶，是周的同姓後裔，後向川東擴展。周武王滅商後，封巴人於巴，在今重慶的巴南區，稱巴子國。公元前316年，秦國滅巴國。一部分留於渝境的巴人成為板楯蠻，而南移到湘西的巴人成為武陵蠻的一部分，遷移到鄂東的稱江夏蠻和五水蠻。巴人以虎為圖騰，巴語讀虎為李，當虎圖騰演化為姓時，巴人崇仰漢人之姓，遂依音用李姓。
此外，李姓還有其他來源，如北魏鮮卑族有複姓叱李氏，在北魏孝文帝遷都洛陽後，實行全面漢化政策，改為漢字單姓李氏。還有一部分中亞細亞人、波斯人和阿拉伯人遷入中國，他們在與漢、維吾爾、蒙古族相處的過程中形成回族，又稱「回回」，其中也有李姓。
綜上所述，李姓的來源多樣，包括嬴姓和姬姓，以及鮮卑族、回族等。