森林被污染的原因主要包括以下幾個方面：
人為原因。包括森林砍伐、燒毀田地、放牧和確保大規模農地而開拓森林、開發滑雪場和其他娛樂設施。特別是由於工業用材、薪柴用量的增加以及農業開墾，導致森林資源遭受破壞。
工廠和汽車尾氣排放。工廠煙氣、汽車尾氣、採暖和居民生活排出的煙氣，以及突發事故如井噴排出的氣體等擴散到森林上空，被植物吸收。煤等燃料燃燒產生的二氧化硫（SO2）等污染物，經降水形成酸雨，對森林造成污染。
農業和種植園的擴大生產。在拉丁美洲，商業性農業的擴張繼續對毀林產生最大的影響，尤其是畜牧業。在非洲，小規模農業是毀林的主要驅動因素。在亞洲是伐木和棕櫚油的種植。
山火。隨著全球氣溫上升，氣候變化和土地用途的改變使野火頻繁爆發，破壞了敏感和富含碳的生態系統，如泥炭地和熱帶雨林。
塑膠污染。塑膠垃圾長期散布在土壤表面，其化學物質滲入土壤和附近水源，對生態系統造成影響。
臭氧和氮氣。這些氣體會增加森林的敏感性，尤其是在乾旱、蟲災、風暴等特殊情況下。
此外，還有頻繁的火山爆發、地殼板塊運動等自然原因也可能導致森林被污染。