機動戰士高達的故事主要圍繞著一群年輕的戰士和他們的機器人——機動戰士（Mobile Suit）——在戰爭中奮勇抗爭展開。以下是故事的主要情節：
1. 地球聯邦政府與奧布聯合的共同開發議題，因為宇宙革命家們的再次舉事而中斷。地球聯邦政府為了維護自己的統治，決定對反叛的宇宙殖民地SIDE-7進行軍事調查，但在此過程中，一台機動戰士高達被發現並帶回。
2. 聯邦政府試圖將高達運回，但途中被神秘組織“W”搶走。該組織宣稱是地球聯邦政府的對立面，反對戰爭和政治權力，他們需要一個獨立的戰士來代表正義，來終結戰爭。高達的出現為該組織提供了一個絕佳的機會。
3. 高達被奧布聯合所隱藏，並且在其年輕駕駛員阿姆羅·雷的帶領下成長，與神秘的宇宙海盜進行戰鬥。在此期間，阿姆羅結識了他的同伴，其中包括駕駛NT-D的高達阿魯迪亞系列阿姆羅的女友：白狼娜娜提歐以及泰坦斯青年艦長傑姆斯等人為機戰界開創了一個特殊的勢力-第三勢力即：除軍事派系與戰艦系列為人類精神抵抗作鬥爭的一群年輕熱血青年。（本劇屬於三部曲的第一部完結篇）。
4. 阿姆羅因為聯邦政府的猜忌而被暗殺，但他並未死亡，而是由神秘的MS開發計畫轉移了生命。新的人類社會已經降臨到我們的宇宙。在這裡，“我們能自由駕駛宇宙機動戰艦機”已成為理所當然的共識，為的是不讓過去歷史重演。而在此之外還存在著未公開的人類與宇宙生物的共生聯合王國——“伊奧利”。王國首領、就是駕駛傳說中的“精神感應高達”的存在，同時也是新的駕駛員安納海姆的摯友、一起展開驚心動魄的冒險故事。
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