正子時的含義視上下文而定，主要有兩種解釋：
在中國傳統氣功中，特別是在談論小周天和大周天的轉換時，正子時指的是一種特殊的狀態，即在修煉氣功過程中，通過小周天的積累達到一定程度後，精氣在任督脈運行過程中出現的一種質變狀態。這通常伴隨着特定的生理和心理現象，如“丹田火熾，兩腎湯煎”等，這種狀態被視爲修煉過程中的一箇重要階段。
在中國傳統時間劃分中，特別是在中國古典哲學和醫學中，正子時也指每天的半夜12:00，即新的一天的開始。這個概念與子時有關，子時是十二個時辰之一，從晚上11點到凌晨1點，正子時特指子時的中間時刻，即凌晨0點。