比目魚的做法有很多種，下面列舉幾種常見的做法：
清蒸比目魚：將比目魚洗淨，用刀在魚身上劃幾刀，撒上適量的鹽、料酒和薑片醃製10分鐘左右。然後放入蒸鍋中大火蒸8-10分鐘，直到魚肉熟透。最後淋上熱油和蔥花，再淋上蒸魚豉油即可。
紅燒比目魚：將比目魚洗淨切段或塊，用料酒和薑片醃製10分鐘。然後燒熱鍋，倒入適量的油，將醃製好的魚兩面煎至微黃，再加入蔥、姜、蒜爆炒出香味，加入煎好的比目魚翻炒均勻。接著加入生抽、老抽、糖、料酒、清水，大火燒開後轉小火慢慢燉煮20分鐘左右，最後撒上蔥花，淋上熱油即可出鍋。
辣椒孜然烤比目魚：比目魚去鱗去鰓去內臟，清洗乾淨後瀝乾水分，雙面斜打一字淺花刀，用鹽抹勻後醃製半小時，然後晾在通風處半天到一天的時間，直到魚皮表面乾爽。接著把表皮風乾的魚擺入烤盤，表面刷層薄油，放入預熱好的烤箱中層，以230度上下火烤制5分鐘，取出後刷油，撒上一層辣椒粉和孜然粗粉，再繼續烤3分鐘即可。
此外，還有酸菜比目魚、蒜蓉比目魚、茄汁比目魚、彩蒸比目魚、豆瓣醬蒸比目魚等多種做法，可以根據個人口味靈活選擇。