水凝膠的使用方法因套用領域不同而有所區別。以下是一些常見的水凝膠使用場景及其方法：
美容面膜。首先清潔乾淨皮膚，然後在臉上拍打一層爽膚水；接著取出適量的水凝膠面膜，均勻塗抹在肌膚上，水凝膠會逐漸凝固；敷上大約15分鐘左右，之後取下面膜並用清水沖洗乾淨；最後完成日常護膚即可。
婦科治療。在使用前需要清洗外陰，然後平躺；將凝膠器前端的前蓋取下，插入裝有凝膠的給凝膠器後端作為推桿，緩慢插入陰道深部；使用期間應避免性生活，並保持外陰的清潔衛生。
創傷敷料。首先清潔創面，然後將水凝膠敷料貼合在創面上；敷料無須頻繁更換，一般3到5天更換一次。
術前準備和舒緩補水。對於激素依賴性皮炎、滲出結痂等情況，水凝膠可以幫助清潔和分離膿痂；對於醫美術後恢復期，水凝膠可以提高藥物的吸收率；對於敏感肌、特異性皮炎等問題皮膚，水凝膠可以起到舒緩補水的作用。
特殊治療。例如殼聚糖婦科抗菌水凝膠，需要在醫生指導下使用。
總的來說，使用水凝膠時應遵循具體產品說明和專業醫生的建議，以確保正確和安全地使用。