水城羊肉粉的配方主要包括以下步驟：
將宰殺好的黑山羊掛起來，把羊皮和羊骨都剔出來，羊板油則從羊肉上分離下來煉製成羊油。然後把羊肉分成大塊和羊雜、羊骨放入大湯鍋內燉煮，待羊肉、羊雜煮到八成熟後撈出晾涼待用；羊骨則留在湯鍋里加入香料包繼續熬製羊湯。
羊肉片鋪在粉上，舀入調好鹽味的原汁湯、羊油、放入煳辣椒粉或辣椒油、再放入味素、花椒粉、蕪荽、蔥花即成。
米粉用涼水泡透去掉酸味，放入沸水鍋中燙透，用漏勺撈出裝入面碗內。
羊肉洗淨切成塊放入鍋中用大火煮沸，去浮沫後改用小火燉，撈出擺齊用重物壓緊，冷卻5小時後切成3厘米寬、5厘米長的簿片。
此外，水城羊肉粉還會配以辣椒油、花椒粉、蒜苗、香蔥、酸菜、香菜等佐料。每一家水城羊肉粉都有自己的密制配料，這配料是不公開的，並不是每家都用一樣的配料。這也是水城羊肉粉的一大特色。吃羊肉粉最講究的是吃原湯味，水城居民喜歡選擇合馬縣一帶產的矮腳山羊，因為這一帶山羊肉質細嫩，腥臊味少，鮮而不腥，這樣的湯尤為鮮美。