水產養殖面臨的主要風險包括：
市場風險。包括供需關係不平衡和價格波動。供需關係受水產品種、季節、地域等因素影響較大，而價格則可能因增產和進口而導致市場競爭激烈，價格下跌。
環境風險。主要是水質污染和天氣條件的影響。水質污染可能由不合格飼料、化學藥品使用、工業廢水等因素引起。天氣條件如水溫變化、水位升降、氣溫驟變等，都可能影響水生物的生長發育和飼料消化吸收。
生物風險。包括疫病爆發和餌料安全。疫病威脅可能導致養殖數量銳減和經濟損失，而不安全的餌料可能引發病蟲害等問題。
禁養區問題。隨著環保意識的提高，越來越多的地區被劃為禁養區，選擇養殖地點時需謹慎考慮。
病害頻發。水產養殖的疾病預防難度大，且水源通常是循環的，難以追蹤潛在污染源。
銷售和契約問題。隨著水產養殖戶的增多，市場競爭壓力加大，銷售問題成為關注點。同時，契約中的條款可能存在模糊之處，導致後期爭議。
水質問題。水質是水產養殖成功的關鍵因素，而水源污染、氧化應激等都是需要面對的問題。