去除水管水垢有多種方法，可以根據不同的水垢類型和可使用的工具選擇合適的方法。
水垢主要是由動植物油脂或礦物性中性油脂性組成，可以使用強鹼進行皂化處理，將其變為水溶性的脂肪酸鈉和甘油，從而易於分散和溶解。酸清洗則是使用酸溶液對管道內的污垢進行浸泡或循環沖洗，酸與污垢發生化學反應，從而清洗乾淨管道內壁，但這種方法可能會對管材造成腐蝕。物理清洗技術則是通過物理力（如熱、攪拌磨擦力、研磨力、壓力、超音波、電解力等）作用於管道內壁上，使污垢脫離管壁。
對於家庭水管，可以採用以下方法：
白醋和溫水混合溶液。將白醋和溫水按1:1的比例混合，倒入被水垢問題困擾的水龍頭或水管中，保持一段時間（約30分鐘），讓混合溶液充分滲透水垢，然後用舊牙刷輕輕刷洗水垢區域，最後用柔軟的布擦拭水垢區域。
使用軟毛刷清潔。將軟毛刷插入水管中，來回摩擦管道內壁，可以有效去除頑固污垢。
沸水沖洗。將沸水緩緩倒入水管中，讓其在管道中停留片刻，然後迅速放空，重複幾次，頑固污垢就會被熱水軟化並沖刷掉。
利用橙皮清潔。橙皮富含天然的檸檬酸和清潔成分，可以很好地去除水管中的污垢。將橙皮切成小塊，放入水管中，然後倒入熱水。
此外，還可以使用高壓水槍進行清潔。對於有水鏽的水龍頭，可以更換鍍鎳的水龍頭頭部的網罩並清理網罩上的鐵鏽。定期清潔可以預防水管長時間積累污垢。