固定水草在沉木上的方法取決於水草的種類和特性。對於有明顯根系的大型水草，如水榕、皇冠、鹿角蕨、黑木蕨等，可以採用以下步驟固定：
確定沉木的位置和角度，以及水草的生長部位。
將水草的根梳理並展開，輕輕貼在沉木上。
使用透明的釣魚線（越細越好）將水草根系綁紮在沉木上，注意不要綁得太緊，以免影響根系生長。綁好後，隨著水草的生長，根系會自然地附著在沉木上。
對於無明顯根莖的細小型水草，如莫斯，可以採取以下方法固定：
先將莫斯浸水。
濕莫斯貼在沉木上。
使用大孔的尼龍網罩將莫斯覆蓋，外面用魚線纏繞幾道綁紮好，可以稍微扎得緊一些，以防在魚缸中飄散。隨著莫斯的生長，新葉會從網眼中長出來，最終遮住包裹物。
此外，也可以使用棉線或細網作為固定工具。棉線柔軟，對水草傷害較小。細網可以均勻地網住水草，特別是在固定莫絲或鹿角苔時更適用。對於有向光性的小型有莖水草，如香香草、宮廷草等，可以使用棉線進行固定，讓其自然生長。對於大型有莖水草，如小榕、鐵皇冠等，可以使用尼龍線進行固定，因為尼龍線不易腐爛，且具有較好的固定力。固定後，將沉木和固定好的水草放入魚缸中即可。