在海底洞穴中，你需要按照以下步驟進行：
確認你身上是否帶了具有碎巖、潛水、衝浪、怪力技能的寶可夢。這是進行海底洞穴探索的基本條件。
從起點下水，一直向下你會發現有一片深色的水域，在這裏按A鍵潛水。
到了水下，先向下走，再向右走。
再向下往左轉你就可以看到一箇洞口。
進去後你會看見一箇潛水艇，按B鍵可以浮上水面。
往左上走，先碎掉這塊岩石。
把巨石推到上面。
向右走再推掉面前擋路的巨石。
進入左上的這個洞。
進洞後清除障礙到達這裏，面前就是令許多人暈頭轉向的海流，下水後直接向上被海流衝到這裏。
接着向右被海流衝到這裏(注意:進這個洞會回到入口處!)。
繼續走右邊的海流吼到達這裏。
再向左，在繞了一大圈後終於上岸了。
打敗那個水戰團成員後向上入洞，這裏就是曾經另許多人蛋疼無比幾近崩潰的巨石陣了。
先向上推中間的石頭。
再推掉左右兩邊的石頭。
把你眼前的這塊巨石推到旁邊。
把中間的那塊巨石推到上面。
洞口就在你眼前了。