海藻糖一般是由以下原料做成的：
大部分海藻糖是採用微生物發酵產生並提取出可以合成海藻糖的酶，再以各類碳水化合物（比如麥芽糊精、澱粉等）爲原料，經過酶處理分解成低聚糖、酸水解、去鹽、冷沉澱、蒸發濃縮、結晶等步驟合成製得。
還有一部分海藻糖是以海藻或者藻類（如紅海藻、棕海藻、褐海藻、綠藻等）爲原料，這些海藻或藻類體內含有大量的藻膠或者角質，經過提取和加工後可以得到純度較高的海藻糖。
此外，海藻糖也可以葡萄糖和半乳糖爲原料，經過混合發酵、提取、制粉等步驟製得。
總之，海藻糖的原料來源比較廣泛，不同的生產工藝所需的原料也不同。