湖泊多的原因主要包括以下幾個方面：
地質構造。青藏高原的地殼或運動活躍，造成地表斷層形成溝谷及窪地，這些地形特徵為湖泊的形成提供了條件。
氣候和降水。青藏高原的降水量雖然不算特別高，但構造活動劇烈，地形年輕，使得該地區能夠滿足湖泊形成所需的條件，即流域內的總降水量大於等於總蒸發量。
冰川作用。青藏高原的冰川活動強烈，冰川的侵蝕作用會形成冰蝕窪地，加之常年積雪和冰川融化，這些冰蝕窪地容易積水形成湖泊。
地殼運動。地殼的斷裂下陷形成狹長或形狀不規則的湖泊，如青海湖、納木錯等。
河流堰塞。河流的泥沙、冰塊等堵塞河道，形成湖泊，如五大連池等。
湖泊的自我調節功能。例如，湖泊能夠調節氣候，冬季降溫慢，夏季升溫慢，為周圍地區提供獨特的氣候條件。
此外，湖泊多的原因還有周邊人口較少，流出河流少，缺少與外界交流的環境；湖泊面積大，湖水純淨，陽光透射率高，為藻類、浮游生物提供豐富的生存空間；入湖河流多，沿湖濕地多，提供豐富的有機營養物質等。