湛江港口主要包括以下區域和碼頭：
霞山區：湛江港霞山港區、湛江港寶滿港區、漁人碼頭、海濱碼頭、特呈島碼頭、特呈島旅遊碼頭、東堤碼頭、情侶碼頭。
開發區：湛江鋼鐵碼頭、中科煉化碼頭、巴斯夫碼頭、平樂碼頭、東南碼頭、硇洲島碼頭、硇洲島漁港、東參渡口。
坡頭區：南三碼頭、南三島北頭寮碼頭、南三島華中港、南三島大王公碼頭、麻斜渡口、南油碼頭、乾塘三合窩碼頭、龍王灣避風港。
雷州縣級市：通明渡口、通明漁港、南渡渡口、康港渡口、三吉碼頭、白嶺渡、徐黃碼頭、站堰碼頭、天成臺度假村-碼頭、流沙港、烏石漁港。
徐聞縣：和安渡口、北港輪渡渡口、海安新港、四季港口、康港渡口、新寮碼頭、水運沙場碼頭、徐聞港、三塘港、海安港、外羅漁港。
廉江縣級市：大渡口、久受埇渡口、鶴地銀湖旅遊中心碼頭、北部灣大墩港郵輪碼頭、龍頭沙漁港碼頭。
吳川縣級市：湧兒渡口、博茂碼頭、王村港、下水港、鶴地渡、渠首碼頭。
遂溪：江洪港、草潭漁港。
赤坎區：湛江港調順港區、金沙灣紅嘴鷗遊船碼頭。
麻章區：雷瓊世界地質公園湖光巖景區-風情園遊船碼頭。
此外，湛江市還有一類和二類口岸，包括湛江港港口口岸和湛江機場航空口岸等。