濃姬的死因並沒有一箇明確的記載，存在幾種不同的說法：
自盡說：有說法認爲濃姬在回到明智家後不久，隨着明智一族自盡身亡。
病逝說：根據江戶時代寬永年間成書的《濃陽諸士傳記》，濃姬與齋藤義龍皆於一五六一年病逝。
雙亡說：這一說法源自歷史小說大師司馬遼太郎的創作《國盜物語》，認爲濃姬與織田信長在本能寺之變中雙亡。
流放說：有觀點認爲織田信長將濃姬流放，並送回美濃國，之後就沒有了關於她的記載。
化名說：還有說法稱濃姬後來化名“安土殿”，於1612年過世，並葬於京都的大德寺總見院。
由於關於濃姬的記載非常有限，這些說法都缺乏確鑿的證據，因此濃姬的確切死因仍然是一箇未解之謎。