在動漫《火影忍者》中，宇智波佐助在忍界大戰結束後，雖然成為了非常接近六道的忍者，但並沒有成為火影。他在忍界大戰結束後被關在木葉的監獄，但最後被卡卡西成功救出。儘管如此，佐助並沒有選擇留在木葉，而是選擇了過上流亡的生活，這可以被視為一種自我救贖。他拒絕了鳴人讓他留下來保護木葉的提議，並選擇了離開。
佐助離開木葉的原因是為了找鼬復仇，這導致他成為了叛忍。在忍界大戰結束之後，佐助在和鳴人的戰鬥中重新找回了自己，並在回到木葉村之後得到了其他人的原諒。他繼承了宇智波鼬的遺志，選擇用自己的方式保護木葉村，並且擁有了家庭，重新定義了愛的含義。
在佐助離開木葉村期間，木葉村經歷了許多挑戰，包括疫情和對四代火影波風水門的死亡所帶來的傷痛。最終，四代火影犧牲了，木葉村各族官員組織了「戰爭」部隊，並用他的精神和願力維持著村莊的安全。
綜上所述，佐助在《火影忍者》中的去向是離開木葉村，過上了流亡的生活，但他最終選擇回歸木葉村，並致力於保護他所重視的人們。