孔姓的來源較為複雜，主要包括以下幾種說法：
出自子姓。商朝建立者商湯的後代中，有一支以「子」姓和商湯名字中的「乙」字組合起來作為姓氏。
出自宋國司馬孔父嘉之後。孔父嘉是西周初期宋國的官員，他的後代中有以孔作為姓氏的。
出自春秋時期姬孔悝、媯孔寧之後。在春秋時期，衛國大夫姬孔悝和陳國大夫媯孔寧的後代中，有以孔作為姓氏的。
出自滿族孔果洛氏、孔尼喇氏等。在滿族中，這些部落的成員後來多改為孔姓。
出於其他原因。如歷史上推行的羈縻政策及改土歸流運動，導致部分土家族、苗族、回族等少數民族將姓氏改為孔。
綜上所述，孔姓的來源多樣，涵蓋了歷史上的多種族群和背景。