狗益生菌可以通過多種方式餵食。將益生菌直接倒在狗狗的嘴巴里，讓其自然吞嚥；將益生菌粉末與狗狗喜歡的食物混合，攪拌均勻後讓狗狗食用；將益生菌粉末倒入溫水中，攪拌均勻後讓狗狗飲用。需要注意的是，益生菌的活性，避免高溫或潮溼，因此溫水沖服時水溫不宜過高，以免破壞益生菌的活性。
常見的益生菌分爲粉劑或片劑，可以加在狗狗的食物中，也可以直接兌水給狗狗服用。片劑的益生菌可以整片給狗狗服用，或者是磨成粉之後再按照粉劑的方式給狗狗使用。
益生菌的用量應根據狗狗的體重和產品說明書上的指導來確定，一般每天給狗狗服用1到2次。最好在飯前或飯後30分鐘內給狗狗服用益生菌，以便更好地發揮作用。同時，要保持狗狗的飲食習慣和飲食量的穩定，避免過度餵食或飲食不規律。
寵物食用的益生菌通常分爲沖劑型和片劑型，可以直接餵食或攪拌在寵物日常食用的糧食中，也可將片劑磨成粉，用40℃以下溫水衝開飲用。建議在諮詢寵物醫生後酌情增減用量。