珊瑚化石的形成是一個複雜的過程，首先，珊瑚是一種多細胞生物，由許多微小的珊瑚蟲組成，每個珊瑚蟲都有自己的口和觸手，用於捕食和感知環境，珊瑚蟲能夠分泌出碳酸鈣，形成堅硬的骨骼，用於支撐身體和保護內部器官，這種骨骼主要由碳酸鈣組成，具有一定的有機質。
當珊瑚蟲死亡後，其骨骼在沉積物的作用下被埋藏，隨後，在長期的地質作用過程中，珊瑚骨骼逐漸被礦物質替代，形成了化石，這一過程被稱為石化或鈣化，最終使得原本是有機質的動物珊瑚轉變為無機質的化石珊瑚。此外，如果珊瑚與矽元素結合，在一定條件下，珊瑚石甚至會玉化。珊瑚化石不僅保留了原始珊瑚的形態和結構，而且由於其化學成分主要為碳酸鈣（CaCO3），它們在地質學和古生物學研究中具有重要意義。