珍珠的形成是一個自然現象，主要發生在珍珠貝類和珠母貝類等軟體動物體內，這些動物在自然環境中受到外來異物（如沙粒、病毒、寄生蟲等）的刺激時，它們的身體會產生反應來保護自己。具體來說，這些軟體動物的外套膜收到刺激後，會分泌出珍珠質，將異物層層包裹起來。隨著時間的推移，這些被包裹的異物逐漸形成珍珠囊，珍珠質不斷積累，最終形成了珍珠。
此外，珍珠的形成也可以由內因引起，例如珍珠貝類在生病時，其外表皮細胞因發生病理變化而產生有效刺激，這部分表皮細胞分裂並游離出去，包裹自身分泌的有機質並陷入外套膜結締組織中，形成珍珠囊，繼續分泌珍珠質形成珍珠。
人工養殖的珍珠是通過類似的過程形成的。在人工養殖的情況下，通常會放入一個核（可能是球形、片形的物體），然後模仿自然條件下的刺激，使貝類分泌珍珠質，最終形成珍珠。